Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms