Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms