Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BORCS6Q96GS4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms