Protein–RNA interactions for Protein: Q96G21

IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4Q96G21 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IMP4Q96G21 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms