Protein–RNA interactions for Protein: Q96FZ7

CHMP6, Charged multivesicular body protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP6Q96FZ7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP6Q96FZ7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHMP6Q96FZ7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP6Q96FZ7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP6Q96FZ7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP6Q96FZ7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP6Q96FZ7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP6Q96FZ7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP6Q96FZ7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP6Q96FZ7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP6Q96FZ7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP6Q96FZ7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP6Q96FZ7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP6Q96FZ7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP6Q96FZ7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP6Q96FZ7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP6Q96FZ7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP6Q96FZ7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP6Q96FZ7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP6Q96FZ7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP6Q96FZ7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms