Protein–RNA interactions for Protein: Q96FS4

SIPA1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1Q96FS4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIPA1Q96FS4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms