Protein–RNA interactions for Protein: Q96DS6

MS4A6E, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6E, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A6EQ96DS6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
MS4A6EQ96DS6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MS4A6EQ96DS6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MS4A6EQ96DS6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MS4A6EQ96DS6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MS4A6EQ96DS6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MS4A6EQ96DS6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MS4A6EQ96DS6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MS4A6EQ96DS6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MS4A6EQ96DS6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MS4A6EQ96DS6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MS4A6EQ96DS6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MS4A6EQ96DS6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MS4A6EQ96DS6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MS4A6EQ96DS6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MS4A6EQ96DS6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
MS4A6EQ96DS6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MS4A6EQ96DS6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MS4A6EQ96DS6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MS4A6EQ96DS6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MS4A6EQ96DS6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MS4A6EQ96DS6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
MS4A6EQ96DS6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MS4A6EQ96DS6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MS4A6EQ96DS6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MS4A6EQ96DS6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MS4A6EQ96DS6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MS4A6EQ96DS6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
MS4A6EQ96DS6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MS4A6EQ96DS6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MS4A6EQ96DS6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MS4A6EQ96DS6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MS4A6EQ96DS6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms