Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NSUN4Q96CB9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NSUN4Q96CB9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms