Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VTI1AQ96AJ9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms