Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
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TRIM63Q969Q1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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TRIM63Q969Q1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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TRIM63Q969Q1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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TRIM63Q969Q1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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TRIM63Q969Q1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
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