Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP13Q92995 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP13Q92995 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP13Q92995 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP13Q92995 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP13Q92995 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP13Q92995 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP13Q92995 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP13Q92995 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP13Q92995 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP13Q92995 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP13Q92995 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP13Q92995 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP13Q92995 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP13Q92995 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP13Q92995 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP13Q92995 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
USP13Q92995 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP13Q92995 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
USP13Q92995 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP13Q92995 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23■■□□□ 1.27
USP13Q92995 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP13Q92995 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP13Q92995 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP13Q92995 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP13Q92995 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP13Q92995 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP13Q92995 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP13Q92995 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP13Q92995 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP13Q92995 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP13Q92995 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP13Q92995 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP13Q92995 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP13Q92995 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP13Q92995 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP13Q92995 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP13Q92995 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP13Q92995 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP13Q92995 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP13Q92995 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP13Q92995 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP13Q92995 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USP13Q92995 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP13Q92995 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP13Q92995 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP13Q92995 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP13Q92995 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP13Q92995 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP13Q92995 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP13Q92995 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP13Q92995 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP13Q92995 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP13Q92995 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP13Q92995 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP13Q92995 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP13Q92995 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP13Q92995 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP13Q92995 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP13Q92995 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP13Q92995 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP13Q92995 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP13Q92995 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP13Q92995 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP13Q92995 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP13Q92995 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP13Q92995 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP13Q92995 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP13Q92995 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP13Q92995 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP13Q92995 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP13Q92995 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP13Q92995 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP13Q92995 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP13Q92995 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP13Q92995 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP13Q92995 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP13Q92995 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP13Q92995 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP13Q92995 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP13Q92995 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP13Q92995 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP13Q92995 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP13Q92995 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP13Q92995 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP13Q92995 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP13Q92995 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP13Q92995 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP13Q92995 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP13Q92995 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP13Q92995 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP13Q92995 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP13Q92995 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP13Q92995 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP13Q92995 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP13Q92995 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP13Q92995 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP13Q92995 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP13Q92995 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP13Q92995 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms