Protein–RNA interactions for Protein: Q92989

CLP1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLP1Q92989 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLP1Q92989 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLP1Q92989 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLP1Q92989 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLP1Q92989 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLP1Q92989 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLP1Q92989 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLP1Q92989 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CLP1Q92989 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLP1Q92989 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLP1Q92989 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLP1Q92989 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLP1Q92989 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLP1Q92989 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLP1Q92989 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLP1Q92989 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLP1Q92989 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLP1Q92989 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLP1Q92989 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLP1Q92989 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLP1Q92989 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CLP1Q92989 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLP1Q92989 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLP1Q92989 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CLP1Q92989 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLP1Q92989 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLP1Q92989 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLP1Q92989 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLP1Q92989 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLP1Q92989 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLP1Q92989 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLP1Q92989 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLP1Q92989 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLP1Q92989 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLP1Q92989 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLP1Q92989 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLP1Q92989 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLP1Q92989 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLP1Q92989 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLP1Q92989 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLP1Q92989 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLP1Q92989 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLP1Q92989 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLP1Q92989 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLP1Q92989 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLP1Q92989 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLP1Q92989 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CLP1Q92989 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLP1Q92989 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLP1Q92989 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLP1Q92989 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLP1Q92989 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CLP1Q92989 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLP1Q92989 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLP1Q92989 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLP1Q92989 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CLP1Q92989 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLP1Q92989 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLP1Q92989 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLP1Q92989 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLP1Q92989 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLP1Q92989 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLP1Q92989 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLP1Q92989 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLP1Q92989 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLP1Q92989 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLP1Q92989 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLP1Q92989 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CLP1Q92989 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLP1Q92989 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CLP1Q92989 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLP1Q92989 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLP1Q92989 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLP1Q92989 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLP1Q92989 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLP1Q92989 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLP1Q92989 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLP1Q92989 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLP1Q92989 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLP1Q92989 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLP1Q92989 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLP1Q92989 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLP1Q92989 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLP1Q92989 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLP1Q92989 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLP1Q92989 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLP1Q92989 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLP1Q92989 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLP1Q92989 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CLP1Q92989 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLP1Q92989 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLP1Q92989 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CLP1Q92989 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CLP1Q92989 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLP1Q92989 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLP1Q92989 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLP1Q92989 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLP1Q92989 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLP1Q92989 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLP1Q92989 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms