Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVT3

TRAPPC12, Trafficking protein particle complex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC12Q8WVT3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC12Q8WVT3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms