Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
C15orf40Q8WUR7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C15orf40Q8WUR7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C15orf40Q8WUR7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C15orf40Q8WUR7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C15orf40Q8WUR7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C15orf40Q8WUR7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C15orf40Q8WUR7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C15orf40Q8WUR7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms