Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEE9

SAP25, Histone deacetylase complex subunit SAP25, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAP25Q8TEE9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAP25Q8TEE9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAP25Q8TEE9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SAP25Q8TEE9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SAP25Q8TEE9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAP25Q8TEE9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAP25Q8TEE9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAP25Q8TEE9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAP25Q8TEE9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAP25Q8TEE9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAP25Q8TEE9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SAP25Q8TEE9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAP25Q8TEE9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAP25Q8TEE9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAP25Q8TEE9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAP25Q8TEE9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAP25Q8TEE9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SAP25Q8TEE9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAP25Q8TEE9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAP25Q8TEE9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAP25Q8TEE9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAP25Q8TEE9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAP25Q8TEE9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms