Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE1

CNIH3, Protein cornichon homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3Q8TBE1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CNIH3Q8TBE1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CNIH3Q8TBE1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CNIH3Q8TBE1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNIH3Q8TBE1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNIH3Q8TBE1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNIH3Q8TBE1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNIH3Q8TBE1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNIH3Q8TBE1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNIH3Q8TBE1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNIH3Q8TBE1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CNIH3Q8TBE1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CNIH3Q8TBE1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNIH3Q8TBE1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNIH3Q8TBE1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNIH3Q8TBE1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNIH3Q8TBE1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CNIH3Q8TBE1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNIH3Q8TBE1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNIH3Q8TBE1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNIH3Q8TBE1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNIH3Q8TBE1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNIH3Q8TBE1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNIH3Q8TBE1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNIH3Q8TBE1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNIH3Q8TBE1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNIH3Q8TBE1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNIH3Q8TBE1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CNIH3Q8TBE1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNIH3Q8TBE1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CNIH3Q8TBE1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CNIH3Q8TBE1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CNIH3Q8TBE1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNIH3Q8TBE1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNIH3Q8TBE1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CNIH3Q8TBE1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CNIH3Q8TBE1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNIH3Q8TBE1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNIH3Q8TBE1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms