Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ATL2Q8NHH9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATL2Q8NHH9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms