Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG06

TRIM58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM58Q8NG06 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM58Q8NG06 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms