Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMIEQ8NEW7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMIEQ8NEW7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
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