Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
TTC21AQ8NDW8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TTC21AQ8NDW8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TTC21AQ8NDW8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TTC21AQ8NDW8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TTC21AQ8NDW8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TTC21AQ8NDW8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TTC21AQ8NDW8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TTC21AQ8NDW8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TTC21AQ8NDW8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TTC21AQ8NDW8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TTC21AQ8NDW8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TTC21AQ8NDW8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TTC21AQ8NDW8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TTC21AQ8NDW8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TTC21AQ8NDW8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TTC21AQ8NDW8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TTC21AQ8NDW8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TTC21AQ8NDW8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TTC21AQ8NDW8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TTC21AQ8NDW8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TTC21AQ8NDW8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TTC21AQ8NDW8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
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TTC21AQ8NDW8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TTC21AQ8NDW8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TTC21AQ8NDW8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TTC21AQ8NDW8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TTC21AQ8NDW8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TTC21AQ8NDW8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TTC21AQ8NDW8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TTC21AQ8NDW8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TTC21AQ8NDW8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TTC21AQ8NDW8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TTC21AQ8NDW8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TTC21AQ8NDW8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TTC21AQ8NDW8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TTC21AQ8NDW8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TTC21AQ8NDW8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
TTC21AQ8NDW8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TTC21AQ8NDW8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TTC21AQ8NDW8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
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