Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC191Q8NCU4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC191Q8NCU4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC191Q8NCU4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC191Q8NCU4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC191Q8NCU4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC191Q8NCU4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC191Q8NCU4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC191Q8NCU4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC191Q8NCU4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC191Q8NCU4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC191Q8NCU4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC191Q8NCU4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC191Q8NCU4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC191Q8NCU4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC191Q8NCU4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC191Q8NCU4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC191Q8NCU4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC191Q8NCU4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC191Q8NCU4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC191Q8NCU4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC191Q8NCU4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC191Q8NCU4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC191Q8NCU4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC191Q8NCU4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.58■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC191Q8NCU4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms