Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APCDD1LQ8NCL9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms