Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB37

GATD1, Glutamine amidotransferase-like class 1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATD1Q8NB37 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GATD1Q8NB37 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATD1Q8NB37 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms