Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PNLDC1Q8NA58 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms