Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J5

PPM1K, Protein phosphatase 1K, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1KQ8N3J5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPM1KQ8N3J5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPM1KQ8N3J5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPM1KQ8N3J5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PPM1KQ8N3J5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PPM1KQ8N3J5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPM1KQ8N3J5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPM1KQ8N3J5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPM1KQ8N3J5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPM1KQ8N3J5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPM1KQ8N3J5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PPM1KQ8N3J5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PPM1KQ8N3J5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PPM1KQ8N3J5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPM1KQ8N3J5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPM1KQ8N3J5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPM1KQ8N3J5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPM1KQ8N3J5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPM1KQ8N3J5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPM1KQ8N3J5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPM1KQ8N3J5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPM1KQ8N3J5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPM1KQ8N3J5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPM1KQ8N3J5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPM1KQ8N3J5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPM1KQ8N3J5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPM1KQ8N3J5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPM1KQ8N3J5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPM1KQ8N3J5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPM1KQ8N3J5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPM1KQ8N3J5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPM1KQ8N3J5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPM1KQ8N3J5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPM1KQ8N3J5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPM1KQ8N3J5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPM1KQ8N3J5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPM1KQ8N3J5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPM1KQ8N3J5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPM1KQ8N3J5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPM1KQ8N3J5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPM1KQ8N3J5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPM1KQ8N3J5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPM1KQ8N3J5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPM1KQ8N3J5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPM1KQ8N3J5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPM1KQ8N3J5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PPM1KQ8N3J5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPM1KQ8N3J5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPM1KQ8N3J5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPM1KQ8N3J5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PPM1KQ8N3J5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPM1KQ8N3J5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PPM1KQ8N3J5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPM1KQ8N3J5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPM1KQ8N3J5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPM1KQ8N3J5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPM1KQ8N3J5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPM1KQ8N3J5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPM1KQ8N3J5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPM1KQ8N3J5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPM1KQ8N3J5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPM1KQ8N3J5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPM1KQ8N3J5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPM1KQ8N3J5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPM1KQ8N3J5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPM1KQ8N3J5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPM1KQ8N3J5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPM1KQ8N3J5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPM1KQ8N3J5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPM1KQ8N3J5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PPM1KQ8N3J5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPM1KQ8N3J5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPM1KQ8N3J5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PPM1KQ8N3J5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPM1KQ8N3J5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPM1KQ8N3J5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPM1KQ8N3J5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPM1KQ8N3J5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPM1KQ8N3J5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPM1KQ8N3J5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPM1KQ8N3J5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPM1KQ8N3J5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPM1KQ8N3J5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPM1KQ8N3J5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPM1KQ8N3J5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPM1KQ8N3J5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPM1KQ8N3J5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPM1KQ8N3J5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPM1KQ8N3J5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PPM1KQ8N3J5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPM1KQ8N3J5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPM1KQ8N3J5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPM1KQ8N3J5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPM1KQ8N3J5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPM1KQ8N3J5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPM1KQ8N3J5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPM1KQ8N3J5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPM1KQ8N3J5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPM1KQ8N3J5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPM1KQ8N3J5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms