Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0T1

C8orf59, Uncharacterized protein C8orf59, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf59Q8N0T1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C8orf59Q8N0T1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C8orf59Q8N0T1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C8orf59Q8N0T1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C8orf59Q8N0T1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C8orf59Q8N0T1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C8orf59Q8N0T1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C8orf59Q8N0T1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C8orf59Q8N0T1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
C8orf59Q8N0T1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C8orf59Q8N0T1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C8orf59Q8N0T1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C8orf59Q8N0T1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C8orf59Q8N0T1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C8orf59Q8N0T1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C8orf59Q8N0T1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C8orf59Q8N0T1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C8orf59Q8N0T1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C8orf59Q8N0T1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C8orf59Q8N0T1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C8orf59Q8N0T1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C8orf59Q8N0T1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C8orf59Q8N0T1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C8orf59Q8N0T1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
C8orf59Q8N0T1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C8orf59Q8N0T1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms