Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYCP3Q8IZU3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP3Q8IZU3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms