Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ69

TRMT2A, tRNA (uracil-5-)-methyltransferase homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT2AQ8IZ69 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRMT2AQ8IZ69 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRMT2AQ8IZ69 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRMT2AQ8IZ69 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRMT2AQ8IZ69 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRMT2AQ8IZ69 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRMT2AQ8IZ69 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRMT2AQ8IZ69 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TRMT2AQ8IZ69 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRMT2AQ8IZ69 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRMT2AQ8IZ69 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRMT2AQ8IZ69 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRMT2AQ8IZ69 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRMT2AQ8IZ69 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRMT2AQ8IZ69 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRMT2AQ8IZ69 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRMT2AQ8IZ69 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRMT2AQ8IZ69 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRMT2AQ8IZ69 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRMT2AQ8IZ69 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRMT2AQ8IZ69 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRMT2AQ8IZ69 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRMT2AQ8IZ69 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRMT2AQ8IZ69 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRMT2AQ8IZ69 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRMT2AQ8IZ69 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
TRMT2AQ8IZ69 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRMT2AQ8IZ69 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRMT2AQ8IZ69 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRMT2AQ8IZ69 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRMT2AQ8IZ69 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRMT2AQ8IZ69 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRMT2AQ8IZ69 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRMT2AQ8IZ69 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRMT2AQ8IZ69 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRMT2AQ8IZ69 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRMT2AQ8IZ69 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms