Protein–RNA interactions for Protein: Q86YI8

PHF13, PHD finger protein 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF13Q86YI8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms