Protein–RNA interactions for Protein: Q86XK7

VSIG1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG1Q86XK7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms