Protein–RNA interactions for Protein: Q86VP3

PACS2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2Q86VP3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PACS2Q86VP3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PACS2Q86VP3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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