Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT6

NLRX1, NLR family member X1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRX1Q86UT6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRX1Q86UT6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms