Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
YTHDF3Q7Z739 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms