Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TCF23Q7RTU1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCF23Q7RTU1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCF23Q7RTU1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCF23Q7RTU1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCF23Q7RTU1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCF23Q7RTU1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCF23Q7RTU1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCF23Q7RTU1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCF23Q7RTU1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCF23Q7RTU1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCF23Q7RTU1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCF23Q7RTU1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCF23Q7RTU1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCF23Q7RTU1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCF23Q7RTU1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TCF23Q7RTU1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCF23Q7RTU1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TCF23Q7RTU1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TCF23Q7RTU1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TCF23Q7RTU1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TCF23Q7RTU1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TCF23Q7RTU1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TCF23Q7RTU1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TCF23Q7RTU1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TCF23Q7RTU1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms