Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTOP3Q7RTS5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms