Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTN6

STRADA, STE20-related kinase adapter protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADAQ7RTN6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 466.6 ms