Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5N7

LPCAT2, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT2Q7L5N7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LPCAT2Q7L5N7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms