Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SV2AQ7L0J3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms