Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC80Q76M96 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms