Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms