Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TPGS1Q6ZTW0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms