Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LINC00299Q6ZSB3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00299Q6ZSB3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms