Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR52

ZNF493, Zinc finger protein 493, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF493Q6ZR52 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms