Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY09

CEACAM20, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 20, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM20Q6UY09 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEACAM20Q6UY09 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms