Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREML4Q6UXN2 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms