Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ABRAXAS1Q6UWZ7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms