Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms