Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJG6

BRAT1, BRCA1-associated ATM activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAT1Q6PJG6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRAT1Q6PJG6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRAT1Q6PJG6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRAT1Q6PJG6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRAT1Q6PJG6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRAT1Q6PJG6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRAT1Q6PJG6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRAT1Q6PJG6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRAT1Q6PJG6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRAT1Q6PJG6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BRAT1Q6PJG6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRAT1Q6PJG6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRAT1Q6PJG6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRAT1Q6PJG6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRAT1Q6PJG6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRAT1Q6PJG6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRAT1Q6PJG6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRAT1Q6PJG6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRAT1Q6PJG6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRAT1Q6PJG6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRAT1Q6PJG6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRAT1Q6PJG6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRAT1Q6PJG6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRAT1Q6PJG6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRAT1Q6PJG6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BRAT1Q6PJG6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRAT1Q6PJG6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRAT1Q6PJG6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRAT1Q6PJG6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRAT1Q6PJG6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRAT1Q6PJG6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRAT1Q6PJG6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRAT1Q6PJG6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRAT1Q6PJG6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRAT1Q6PJG6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRAT1Q6PJG6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRAT1Q6PJG6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRAT1Q6PJG6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRAT1Q6PJG6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRAT1Q6PJG6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRAT1Q6PJG6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRAT1Q6PJG6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRAT1Q6PJG6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRAT1Q6PJG6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRAT1Q6PJG6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
BRAT1Q6PJG6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRAT1Q6PJG6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRAT1Q6PJG6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRAT1Q6PJG6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRAT1Q6PJG6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRAT1Q6PJG6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRAT1Q6PJG6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRAT1Q6PJG6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRAT1Q6PJG6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRAT1Q6PJG6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRAT1Q6PJG6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRAT1Q6PJG6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRAT1Q6PJG6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRAT1Q6PJG6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRAT1Q6PJG6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRAT1Q6PJG6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BRAT1Q6PJG6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRAT1Q6PJG6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRAT1Q6PJG6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BRAT1Q6PJG6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
BRAT1Q6PJG6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
BRAT1Q6PJG6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRAT1Q6PJG6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRAT1Q6PJG6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BRAT1Q6PJG6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRAT1Q6PJG6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRAT1Q6PJG6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRAT1Q6PJG6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRAT1Q6PJG6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRAT1Q6PJG6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRAT1Q6PJG6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRAT1Q6PJG6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRAT1Q6PJG6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRAT1Q6PJG6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRAT1Q6PJG6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRAT1Q6PJG6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BRAT1Q6PJG6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRAT1Q6PJG6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRAT1Q6PJG6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRAT1Q6PJG6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRAT1Q6PJG6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRAT1Q6PJG6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRAT1Q6PJG6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRAT1Q6PJG6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRAT1Q6PJG6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRAT1Q6PJG6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRAT1Q6PJG6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRAT1Q6PJG6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRAT1Q6PJG6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRAT1Q6PJG6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRAT1Q6PJG6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRAT1Q6PJG6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRAT1Q6PJG6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRAT1Q6PJG6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRAT1Q6PJG6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms