Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZCCHC12Q6PEW1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms