Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTC41PQ6P2S7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC41PQ6P2S7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms